Su asesinato marcó el inicio de la escalada de violencia en San Luis Potosí, Jaime Flores Escamilla fue traicionado por sus jefes y por las autoridades del entonces Gobierno Estatal del panista Marcelo de los Santos Fraga.
En espera de recibir sentencia, luego de ser encontrado culpable por diversos delitos contra la seguridad y la salud, Genaro García Luna fue el organizador de desestabilizar la paz y la tranquilidad en el país durante el gobierno de Felipe Calderón, situación que afectó al estado de San Luis Potosí por ser un punto estratégico para las operaciones del Cartel de Sinaloa a quien fue entregado el estado potosino por las autoridades surgidas de Acción Nacional.
Teniendo como aliado a Marcelo de los Santos Fraga también de extracción panista, poco a poco fueron atentando y se realizaron ataques directos contra funcionarios de Seguridad y empresarios que sufrieron secuestros, algunos tuvieron que emigrar de San Luis Potosí por seguridad.
El año 2007, de los últimos en la administración de De los Santos Fraga, San Luis Potosí vivió episodios lamentables de inseguridad, cómo olvidar la tarde del jueves 13 de septiembre, cuando Jaime Flores Escamilla jefe de la extinta DGSPE fue acribillado a balazos por una célula del crimen organizado, versiones no oficiales apuntan que “lo puso” Marco Antonio Novella Juárez; Novella Juárez fungió hasta finales de septiembre de 2007 como secretario técnico del Consejo Estatal de Seguridad Pública de San Luis Potosí, cargo que dejó para trabajar con García Luna.
Posteriormente, entre los meses de octubre y noviembre continuaron los hechos de violencia en San Luis, un fuerte enfrentamiento se registró en el centro comercial El Dorado, un grupo armado irrumpió para intentar secuestrar a un joyero, sus escoltas evitaron dicha acción y repelieron la agresión a balazos, en medio de la confusión de la gente que acudía a realizar sus compras o pasear en el lugar.
Más tarde, el 30 de noviembre otro negro episodio de sangre se registró en la historia del San Luis Potosí de Marcelo de los Santos, una balacera que inició en Avenida Carranza continuó por la calle Independencia y continuó hasta el periférico, nunca hubo detenidos, fueron seis los muertos en el primer cuadro de la ciudad, escoltas y policías cayeron en el cumplimiento de su deber. De este suceso se sabe que el ataque iba dirigido contra Cesáreo Carvajal Guajardo, entonces Secretario técnico del Consejo de Seguridad del Estado, en sustitución de Novella Juárez.
Al final Marcelo de los Santos Fraga entregó al Estado para las conveniencias y pactos que Genaro García Luna realizaba con grupos de la delincuencia organizada.
